吉林大学兽医教育始于1904年（清光绪30年）清政府在河北保定成立的马医学堂，它是中国第一所兽医学校，也是中国现代兽医教育的起源。新中国成立后，历经解放军兽医大学、农牧大学和军需大学，2004年转隶并入吉林大学，原军事兽医系改建为畜牧兽医学院，2012年更名为吉林大学动物医学学院。目前，学院专任教师91名，其中教授55名，副高职27名，拥有国家级人才称号的14人，吉林省“教学名师”2名，博士生导师48名，已有32人次在国家级学会或专业委员会任副理事长以上职务，先后培养产生3名中国工程院院士。

学院设有1个本科专业：动物医学，它是我国首批一流本科专业建设点。2014年开始试办动物医学（卓越农林人才拔尖培养计划）试验班，在校本科生503人。现有1个硕士学位授权点，1个一级学科博士点（含兽医博士专业学位授权点），兽医学为国家一级博士学位授权学科，博士后科研流动站，预防兽医学为国家重点学科，基础兽医学为国家重点（培育）学科，“人与动物共有医学”为国家首批“双一流”自主建设学科。在校硕士研究生330名，博士研究生238名。

学院拥有人畜共患传染病重症诊治全国重点实验室、世界动物卫生组织(OIE)亚太区食源性寄生虫病协作中心、人兽共患病教育部重点实验室、动物胚胎工程吉林省重点实验室、吉林省兽药工程研发中心、动物疫病诊断与防治中心、吉林省“人兽共患病”重大需求协同创新、吉林省转化生物学与健康工程中心、吉林省动物生物工程研究中心等8个省部级科研平台。动物科技实验教学中心为国家级实验教学示范中心，近3年，承担国家重点研发计划、国防科技创新项目、国家“973”、“863”、国家自然科学基金课题、中法先进计划及省部级科研项目130余项。

学院始终坚持以教学为中心，以培养人才为基本任务。学生推荐为免试研究生的比例为15%，其中85%被外保到中科院、北京大学等著名科研院所。读研人数约占毕业生总数的60%，学生一次性就业率在98%以上。

学院坚持开放办学，注重国际交流，同日本、美国、法国、德国、瑞典、丹麦、新西兰等20多个国家的院校、科研单位保持密切学术联系，与日本北里大学定期互派本科学生，接受世界各国的留学生。作为中国现代兽医教育的起源地，在新的历史发展时期，学院将充分发挥学科专业、人才培养、科学研究、师资队伍的优势和特色，努力使学科整体水平达到国内领先，重点学科达到国际先进水平，成为国家高质量创新型人才培养，高水平科学技术研究和成果转化的重要基地，加快实现“创建国内领先的研究型动物医学学院”的宏伟目标。